Das Gefängnis von Iwagakure ist ein Hochsicherheitstrakt für Schwerverbrecher und Nukenin. Dieses liegt direkt unter dem Haus des Tsuchikage, tief im Berg vergraben. Das Gefängnis wird hier fast ausnahmslos von ANBU bewacht. Es gibt jeden Tag einmal einen Gang noch weiter hinunter in eine Mine, bei welchem die Gefangenen körperliche Arbeit vollrichten müssen. Nach verrichteter Arbeit wird jeder einzelne Verbrecher kontrolliert, damit keine gefährlichen Gegenstände herein geschmuggelt werden können.